欧洲各大机场已开始不定期暂停新入境/出境系统（Entry/Exit System，简称EES）中的生物识别检查，因为该系统的运行会导致护照检查处排队过长，并可能造成航班延误。
根据现行欧盟过渡机制，在特殊情况下可暂时暂停采集乘客指纹和拍摄照片，该机制有效期至2026年9月6日。
已有九个欧洲国家要求在9月6日之后继续保留这一权限。比利时、法国、德国、希腊、意大利、马耳他、荷兰、葡萄牙和瑞士共同发出了这封联名信。这些国家支持继续使用欧洲入境系统（EES），但同时警告称，在客流高峰期，该系统会造成严重的运营问题。
在夏季旅游旺季期间，大型旅游机场的运行故障尤为明显。在某些情况下，边境管理部门会暂时取消部分生物识别程序，以便更快地放行旅客，避免航班时刻表被打乱。
米兰-利纳特机场发生的一起事件最具代表性。4月12日，由于边境检查处排队等候数小时，易捷航空飞往曼彻斯特航班的122名乘客未能及时登机。在156名已办理登机手续的乘客中，飞机最终仅载着34人起飞。
EES系统将于2025年10月12日开始逐步实施，并自2026年4月10日起在29个欧洲国家的外部边境全面生效。该系统取代了护照上的入境章，记录旅客的入境和出境日期及地点、证件信息、面部图像和指纹。
该系统适用于来自欧盟以外国家的公民，即在任何180天内短期（不超过90天）前往EES成员国的旅客。无论旅客是否需要申根签证，或来自实行免签制度的国家，均适用该系统。
特别是乌克兰、格鲁吉亚、摩尔多瓦、塞尔维亚、黑山、波斯尼亚和黑塞哥维那、北马其顿以及阿尔巴尼亚的公民需通过EES系统，该规定同样适用于英国、美国、加拿大、澳大利亚及其他第三国公民。
对于乌克兰公民，存在一项重要例外。凡持有有效居留许可、长期签证或赋予其在EES适用国之一居留权的文件者，均不会作为普通短期旅客在该系统中登记。因此，基于相应居留身份长期居留欧盟的大多数乌克兰公民，无需在每次旅行时都通过EES系统。相反，那些凭借免签政策短期赴欧盟的乌克兰公民则需接受该系统的审查。
目前，由于英国与欧洲各机场之间的客流量巨大，该系统对英国公民产生的实际影响最为显著。英国脱欧后，英国公民在短期旅行时，在EES系统中被视为第三国公民。正是在欧盟与英国之间的航线上，已经出现过因护照检查排队过长导致乘客错过航班的情况。
尽管如此，欧盟委员会并不打算放弃EES系统。布鲁塞尔认为该系统是管控外部边境的重要工具：它能够自动追踪第三国公民的停留时长，识别他人证件或伪造证件的使用情况，并记录以往的入境拒绝记录。
9月6日将成为关键日期。如果现行的灵活性机制未获延长，当排队人数急剧增加时，边境部门将更难暂时暂停生物识别程序。欧盟和申根区内的九个国家正努力争取保留这一可能性，担心欧洲主要机场会再次出现混乱。
